Nausicaä wraz z Bożym Wojownikiem wyrusza do krypty Shuwa, gdzie ukryto tajemnice mogące zadecydować o losach świata. Po odkryciu prawdy o Morzu Skażenia dziewczyna musi podjąć decyzję, od której zależeć będzie przyszłość ludzkości i natury. Tak rozpoczyna się finał niezwykłej opowieści o świecie stojącym na granicy odrodzenia i zagłady…